1、海关事务由财政部下属的联邦税务总局负责
根据巴西海关条例，巴西海关系统（SISCOMEX）是所有进出口货物报关程序的登记网站，所有的海关事务由财政部下属的联邦税务总局具体负责。一般来说如果在SISCOMEX输入了货物申报单则报关程序开始，与此同时，进口商还需按要求向海关提供相关单证，海关会对货物申报的内容一一进行核实，核实一致后SISCOMEX则会授权进口商提货。虽说联邦税务总局负责海关事务，但是进口流程中每一个环节都由不同的机构负责。
2、NCM CODE
NCM CODE 或者 NCM NO. 是指巴西的海关编码，巴西海关要求入境到巴西的货物都必须在运单提单上显示其对应的NCM CODE。
3、分通道抽检方式
进口商在SISCOMEX中登记进口报关文件后，报关文件将会被系统自动提交，并根据进口商纳税、贸易行为、进口货物性质、数量及价格、征税情况、货物原产地、出口地、进口商运营能力和经济实力等多种因素进行分析后，被分配到不同的清关通道实施分类抽检，即按照以下5种不同颜色的通道对货物进行分类处理：
1) 灰色标识：报关文件、货物和商品价值需经检查后方能通关
2) 红色标识：报关文件和货物需经检查后方能通关
3) 黄色标识：报关文件经检查后方能通关
4) 西瓜标识：根据对报关文件的查验结果将货物归入红色标志或绿色标志
5) 绿色标识：报关货物可全部免检并自动通关。但是海关官员有权对其重新进行分类
海关政策简介
1、CNPJ
CNPJ(Cadastro Nacional da Pessoa Juridica)由巴西财政部颁发，即法人国家登记号（这里的法人则是指公司），一般由14位数字组成。出口到巴西包括寄样品等都必须提供客户公司的CNPJ，即海关税务编号。
2、RADAR
RADAR即巴西进出口许可证，一些NCM（HS代码）项下货物需要进口许可证才能进口至巴西。这时，企业需要向有关机构提交形式发票并等待15至30天或更长时间来获得批准。而这些代理机构也可能需要60天或更长时间才能给予许可证的批准。此外，如果最终商业发票与之前提供的形式发票的信息不一致，那幺之前申请的进口许可证将会失效，进口商只能重新申请一个新的许可证。
RADAR包括自动进口许可证和非自动进口许可证两种。其中，自动进口许可证的审批过程比较简单且自动批准，而非自动许可证的申请及审批由巴西外贸局（DECEX）负责。
3、非自动进口管理
非自动进口许可证管理的产品主要包括需要经过卫生检疫、特殊质量测试的产品，对民族工业有冲击的产品及高科技产品，以及军用物资等国家重点控制的产品。
4、特殊的提单要求
在巴西海关，所有的无单货物（单证信息缺失或错误）靠港卸货后将被视为走私，立即被海关扣押并处以罚款。同时，巴西海关对正本提单也有如下特殊要求：
1) 收货人不得为“TO ORDER”。若提单上面的收货人（Consignee）显示为“TO ORDER”，货物将会被海关扣留，直至向巴西海关系统提交收货人的详细资料（包括完整地址，企业税号CPNJ，电话、传真等联系方式及联系人等），海关才会允许提货。
2)巴西海关不接受通用货物描述。如：department good, merchandise, Chemical, Dry cargo等。
3)必须标注收货人（Consignee）的企业税号CPNJ、货物的巴西商品海关编码NCM code。如果Notify与Consignee不同，也必须标识其企业税号CNPJ。此外，提单上必须标识出货物的体积（单位立方米）。
4）运费必须用数字和文字同时在提单上注明。
5、注意申请Free Time和Free Storage
巴西通关手续繁杂，效率低下，导致清关时间相对较长。出口企业应注意申请相应的Free Time（包括Free Demurrage和Free Detention）和Free Storage来减少不必要的成本支出。
巴西清关注意事项
巴西海关特点有三，效率低、流程繁琐、不透明。这些都忍了，稍不注意还非常容易引来高额罚金。小编汇编部分巴西清关的注意事项，希望能引起各位相当重视。
1、正本原件提单
巴西清关对于单证的要求必须是正本原件提单，不接受电放。进口货的提单上必须SHOW 海运费。如果出HBL（货代单），HBL的总海运费不得低于MBL（船东单），否则整个箱子在目的港无法清关。运费高低无关轻重，值得注意的是巴西运费只能做预付PREPAID，不可以海运费COLLECT。出HBL的，必须是NVOCC而且在巴西海关注册备案过的才有效，可以高显运费。所以，不要排斥货代提单，货代单一样好处很多。
2、抽检
巴西海关对报关货物实行抽检的方式，即按照绿色、黄色、红色、灰色四种不同颜色分类处理。绿色：即报关货物可全部免检,并自动通关;黄色：即仅检查报关文件,核实后,货物自动通关;红色：即报关文件和货物均需经过检查后方能通关；灰色：除对文件和货物进行核查外，还需执行海关特殊监管程序，核实是否存在欺诈行为。根据规定,海关应在5个工作日之内提出验货结果,验货时当事人应在场,货物若需样检,所发生费用由当事人承担。如果货物不幸抽到红色通道报关，时间就会相对较长，一般需要15天左右。
3、FREE TIME DETENTION和FREE TIME DEMURRAGE
FREE TIME DETENTION 指货物抵港后集装箱拖离码头外的免租期；FREE TIME DEMURRAGE 指货物抵港后集装箱在码头内的免租期。两个时间都可以向船公司申请，但为了不造成码头的拥堵，船公司一般只给7天的FREE TIME DEMURRAGE；FREE TIME DETENTION 可根据和船公司的关系去申请，最好可以拿到28天FREE TIME DETENTION甚至更多天数。巴西的一般做法是，货到港以后，客人会要求代理把柜子拖到码头外附近的TERMINAL去完成清关程序。这样可以充分利用FREE TIME DETENTION。
4、IMPORT LICENSE
对于第一次做巴西业务或者不熟悉巴西市场的客人，最好先找到产品的海关编码，巴西称为 NCM NO.。对照此NO.查询此产品是否需要巴西海关要求提供的进口许可证，进口许可证分为自动进口许可证和非自动进口许可证两种。自动进口许可证的审批过程比较简单且自动批准；非自动许可证的申请及审批由巴西发展工商部外贸局（DECEX）负责，发放由各相关机构处理。进口商一般应在货物装船前向DECEX提出申请,进口许可证有效期为60天。货物到港后90天内进口商应办理报关手续,并将进口申报单输入“巴西外贸网”进行登记,开始报关程序；同时还需向海关提供装船单、商业发票、纳税单据、以及原产地证、商检证明和动物检验证明等文件。
海关收到上述文件后,对申报内容和货物进行核实，如完全一致,即通过“巴西外贸网”授权通关,此时进口商方可清关提货。如果不一致，那也没关系，修改一次费用为2800美金。
5、开船日期
货物开船日的时间，以提单上ON BORAD DATE 为准，如果早于进口许可证申请下来的时间，比如开船日是2015年3月1日，但进口许可证申请下来的时间是2015年2月28日，货到港后，经巴西海关核实查出，目的港客人需要支付USD 1500左右的罚金。
6、提单的其他要求
（1）巴西清关需要在提单上显示CNJP/CPF/NCM，CNPJ和CPF是巴西公司和个人的身份号码，也就是税号;NCM：这是货物身份确认号码，相当于中国HS编码，必须显示在载货单上。
（2）收货人不得为“TO ORDER”。若提单上面的Consignee显示为“TO ORDER”，货物将会被海关扣留，直至向巴西海关系统提交收货人的详细资料（包括完整地址，企业税号CPNJ，电话、传真等联系方式及联系人等），海关才会允许提货。
（3）不接受通用货物描述，如：department good, merchandise,Chemical,Dry cargo等，在货物描述处不允许填有货值申明。只能以公尺制的方式正确显示重量，填写货物的净重。
以上是巴西清关的一些特殊注意事项，实际规定可能略有变动，具体操作请以巴西当地政策为准。
