通俗一点来讲，自理报关便是企业自身去操作进出口报关相关业务，报关代理便是交由国际货代公司去报关。
不论是自理报关或是报关代理，对自己的报关服务管理都是非常重要的，尤其是想要成为AEO资质认证企业的情况下，那就要有合乎海关部门AEO认证体系的报关智能管理系统数字化管理内部报关服务，报关智能管理系统的情况下云关通的报关服务体系非常好。有进出口经营权的选择自理报关或是报关代理都可以，都没有的话就只能选报关代理了。
自理报关和报关代理主要是针对货物报关来讲，两者之间务必依规依法在海关注册登记后才能申请报关业务;
两者之间差别：
1、自理报关单位为经济贸易主管部门许可，有进出口经营权的公司。自理报送单位能够对外部签订，并只可以向海关部门申请办理自身所签订项目下的进出口货物的报关手续，不可以代办其他公司合作的货物报关手续。
2、报关代理公司是具备相关部门审批的对外;商贸仓储运输、国际运载工具、国际运载工具服务和代理等项目运营权，兼营报关服务业务的企业。报关代理公司是历史承袭而成，如外运、外代有限公司等。它只可以代理该企业所承包的物品的报关业务。
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